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30 août 2016.

Mesurer la biodiversité des rivières grâce à leur ADN environnemental

Le biologiste suisse Florian Altermatt est formel : "Nous (...)

Le biologiste suisse Florian Altermatt est formel : "Nous pourrons bientôt mesurer la diversité biologique comme on mesure les paramètres physico-chimiques de l’eau." Avec une équipe de chercheurs, il vient même de démontrer que cette idée était tout à fait praticable en extrayant tout l’ADN de la Glatt, une rivière zurichoise, par le biais de prélèvements d’eau à divers points de son parcours.

Professeur à l’Institut de Biologie de l’évolution et de Sciences de l’environnement de l’Université de Zurich et à l’Institut fédéral de recherche sur l’eau (Eawag) à Dübendorf, Florian Altermatt vient de publier les résultats de cette recherche dans la revue Nature Communications.

Jusqu’à présent, pour mesurer la biodiversité des rivières, il fallait patiemment collecter, identifier et analyser une à une toutes les espèces présentes dans le cours d’eau. Désormais, grâce à l’ADN laissé par les divers organismes dans les matrices environnementales comme l’eau ou le sol, il est possible de le faire non seulement dans la rivière mais également dans les milieux limitrophes.

Il faut savoir en effet que tous les organismes libèrent en permanence de l’ADN dans leur milieu environnant, par exemple sous la forme de peaux ou de déjections. Les nouvelles techniques des sciences biologiques permettent aujourd’hui de séquencer cet ADN dit environnemental puis de le comparer avec les données recueillies par les méthodes traditionnelles pour vérifier que les organismes détectés vivent réellement dans le milieu étudié.

Dans des études antérieures, l’équipe de chercheurs coordonnée par le professeur Altermatt avait déjà montré que l’ADN était transporté sur des kilomètres dans les rivières. Plus encore : les échantillons d’eau ne contiennent pas seulement des informations sur les organismes aquatiques mais également sur ceux qui vivent dans le milieu terrestre environnant.

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De simples échantillons d’eau puisés dans une rivière offrent la possibilité d’en déterminer aussi son degré de biodiversité (photo : Eawag)

Dans leurs travaux sur la Glatt, les scientifiques ont ainsi récolté les empreintes génétiques des organismes de tout le bassin versant de la rivière zurichoise et ont réussi à démontrer le potentiel de l’ADN environnemental pour la détermination de la diversité biologique des animaux. "Dans un seul litre d’eau, explique Florian Altermatt, nous avons trouvé l’ADN d’un nombre étonnant d’espèces, allant des insectes aquatiques comme les éphémères aux castors qui vivent un peu plus haut".

Et comme il est désormais possible d’automatiser les procédés scientifiques, on peut imaginer – c’est l’une des conclusions de cette étude – que les services publics chargés d’analyser les échantillons d’eau régulièrement prélevés dans les rivières pour en surveiller la qualité physique et chimique pourront également, dans un avenir pas très éloigné, en déterminer aussi la biodiversité. (Source : Eawag)


- Florian Altermatt & all., "Environmental DNA reveals that rivers are conveyer belts of biodiversity information", Nature Communications, August 30, 2016.




Mots-clés

Glossaire

  • Eau potable

    La législation suisse sur les denrées alimentaires définit l’eau potable comme une "eau naturelle ou traitée qui convient à la consommation, à la cuisson d’aliments, à la préparation de mets et au nettoyage d’objets entrant en contact avec les denrées alimentaires". Cette eau doit être "salubre sur les plans microbiologique, chimique et physique". La loi définit de manière précise les exigences de qualité auxquelles elle doit satisfaire en tout temps et les concentrations maximales admissibles de diverses substances.

Mot d’eau

  • Eaux de source

    "Rosette témoigna, pour apaiser sa soif, le désir de boire aussi de cette eau, et me pria de lui en apporter quelques gouttes, n’osant pas, disait-elle, se pencher autant qu’il le fallait pour y atteindre. Je plongeai mes deux mains aussi exactement jointes que possible dans la claire fontaine, ensuite je les haussai comme une coupe jusqu’aux lèvres de Rosette, et je les tins ainsi jusqu’à ce qu’elle eût tari l’eau qu’elles renfermaient, ce qui ne fut pas long, car il y en avait fort peu, et ce peu dégouttait à travers mes doigts, si serrés que je les tinsse." (Théophile Gauthier, "Mademoiselle de Maupin", (...)

Mot d’eau

  • « Le fleuve me hantait »

    "La proximité de sa grandeur réveillait en moi une antique terreur des eaux qui, en présence des rivières et des fleuves, même vus du rivage, me tourmente l’âme. La fluidité des eaux fluviales, lentes ou rapides, me trouble, où je décèle un monde à demi visible de formes fugitives qui tentent et parfois fascinent l’âme inattentive. Ce sont des êtres sinueux et insinuants que les fleuves et les rivières, même farouches." (Henri Bosco, "Malicroix", 1948)


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